9月15日，在斯特拉斯堡举行的欧洲议会全体会议以404票赞成、153票反对、37票弃权，通过了对新一届欧盟委员会的任命，从而结束了为期6个月的欧盟机构危机。
以意大利前总理普罗迪为主席的新一届委员会本月17日在卢森堡欧洲法院宣誓后正式开始运行，其任期至2005年1月结束。
由于内部管理混乱、任人唯亲和资金管理上出现的一系列违规现象，以桑特为首的欧盟委员会在面临弹劾的情况下，被迫于今年3月16日宣布集体辞职。在此后的6个月中，在欧洲建设中一直处于中心地位的委员会成了只是处理日常事务的“看守内阁”。这在欧洲建设历史上还是第一次。
3月24日，欧盟特别首脑会一致推举普罗迪作为桑特的接班人，并于5月4日得到议会认可。7月9日，普罗迪宣布了新一届委员会的组成名单。根据《阿姆斯特丹条约》规定，委员会必须获欧洲议会批准后才能正式开始工作。
从8月31日到9月7日，欧洲议会对19名委员分别举行听证会。听证会后，绿党要求改变负责内部市场的委员博尔克斯泰因和负责与欧洲议会关系的委员德帕拉西奥的分工，英国保守党和部分德国基民党议员以涉嫌“阿古斯塔直升机采购贿赂案”为由，要求撤换比利时前法语社会党主席、负责研究事务的委员比斯坎。到议会投票的前一天，还一直有消息说比斯坎可能难以过关。但欧盟条约规定，议会只能对整个委员会组成表示赞成或反对，而无权直接撤换某个成员或决定委员的分工。在普罗迪向议会作出一旦某个委员涉及司法纠纷，他就要求他辞职后，议会终于对“普罗迪内阁”开了绿灯。
委员会、理事会、议会是欧盟三大主要机构。代表各成员国政府的理事会是决策机构；总共有626名议员组成的欧洲议会代表3．75亿欧洲公民，除参与决策外，对委员会负有监督权；委员会既是条约的监护人、各项政策法规的提议人，也是欧洲政策的执行人，并代表欧盟参与国际贸易谈判。三大机构中最庞大的是被称为“欧洲政府雏形”的委员会，总共有23个总司、2000多名工作人员。
在欧洲议会批准对“普罗迪内阁”的任命后，处于瘫痪状态已有半年之久的委员会将重新开始正常运转。
欧洲舆论普遍认为，在欧洲建设历史上，凡是委员会强大，欧洲建设就顺利发展，反之就停滞不前。
实际上，委员会是强是弱，既取决于各委员特别是主席的政治声望和工作能力，更取决于各成员国的政治意愿。因为，欧盟的最高决策机构毕竟是代表各成员国利益的理事会。
摆在普罗迪和他19位同事面前的任务并不轻松：如何以有限的预算继续执行目前的各项政策；如何结束各国税收制度的协调；如何完成欧元的过渡；如何继续东扩谈判；如何迎接新一轮世界贸易谈判；如何推进共同外交和安全政策；如何加强司法和移民政策的协调；如何完成科索沃重建；特别是如何完成内部机构的改革。
普罗迪在议会的讲话中表示，欧盟目前正面临三大基本挑战，首先是扩大，其次是机构改革，然后是保证经济增长、创造就业和持续发展。他认为，应该“明确那些准备比较充分的国家的入盟日期”。而多数成员国则反对制订明确的时间表。普罗迪也赞成多数成员国提出的关于分阶段进行机构改革的意见，他认为这种无休止的机构改革既使公民感到困惑，也是浪费精力。此外，随着欧洲议会权力的扩大，委员会必须越来越多地受到议会的牵制。
